НЕпривязка счетчика метрики к вебмастеру не должна быть "возможной проблемой"
Сообщение "Счётчик Яндекс Метрики не привязан к сайту" Не должно обозначаться как Возможные проблемы.
Сделайте, чтобы это было в разделе Рекомендации.
Отправка адресов из метрики роботу несет негативные последствия, так как под обход попадают разные страницы с параметрами и другие закрытые страницы (например какие-то тестовые разделы), куда нормальными путями робот не должен попадать.
Есть клиенты, которые просматривают вебмастер и видят сообщение об ошибке, как минимум приходится объяснять, что эту опцию не нужно включать, а как максимум приходится исправлять проблемы после того, как клиенты сами включат обход по счетчику.
Это не должно быть "ошибкой", это должно быть "рекомендацией", причем с предупреждением, что это может вызвать попадание в индекс ненужных страниц.
Ну слушай, как бы там ни было, если у тебя в индекс попадают ненужные страницы, ты явно что-то делаешь не так. Настрой роботс нормально и ответы на страницах (404, no-index, canonical).